扎脐针可能存在一些危害，比如操作不当可能导致局部感染。有研究表明，如果脐部皮肤本身有破损、炎症等情况时进行脐针操作，感染的风险会明显增加。
可能导致局部组织损伤
操作不规范时： 如果施针者手法不熟练，进针深度把握不好，有可能会损伤脐部周围的组织，比如肌肉、血管等。例如进针过深，就可能刺破脐部附近的小血管，引起局部淤血、肿胀等情况。个体差异影响： 不同人的脐部组织状况不同，有些人脐部皮肤较薄、皮下组织疏松，相对更容易在扎脐针时受到损伤。比如一些皮肤敏感或者脐部有特殊生理结构异常的人，扎脐针后出现局部不适的概率可能更高。
引发身体不适反应
疼痛与不适感： 部分人在扎脐针后可能会出现局部疼痛的情况，而且这种疼痛可能会持续一段时间。有的人对疼痛比较敏感，扎脐针后会感觉脐部及周围有明显的酸痛感，影响正常的活动和休息。全身反应少见但需警惕： 虽然比较罕见，但也有个别人在扎脐针后可能出现全身反应，比如头晕、恶心等。这可能是因为针刺刺激引起了身体的应激反应，不过一般这种全身反应持续时间较短，大多能自行缓解，但如果症状持续不缓解甚至加重，就需要及时就医。
不符合规范操作的风险
非正规场所操作隐患： 如果是在一些没有资质、不正规的场所进行脐针操作，那么操作人员的专业水平和消毒等操作都难以保证。非正规场所可能没有严格的消毒流程，容易导致脐部感染，进而引发更严重的健康问题，像脐部感染扩散引起蜂窝织炎等情况就有可能发生。未充分评估体质的风险： 没有对人体体质进行充分评估就扎脐针也存在风险。比如体质虚弱、有出血倾向的人，如果盲目扎脐针，可能会加重出血倾向或者导致身体更虚弱等情况。比如本身有血小板减少性紫癜的人，扎脐针后可能会引起脐部出血不止等严重后果。