中性粒细胞低淋巴细胞高可能由多种原因引起。比如病毒感染时较为常见这种情况，像流感病毒感染后，可能会出现中性粒细胞计数降低，而淋巴细胞计数升高，一般病程可能在1 - 2周左右能逐渐恢复。
感染因素导致
病毒感染： 很多病毒感染会引发中性粒细胞低淋巴细胞高。例如风疹病毒感染，感染后机体免疫系统被激活，淋巴细胞会增多来对抗病毒，同时中性粒细胞可能因参与早期免疫反应后功能变化或生成受影响而降低。又如EB病毒感染，也常出现中性粒细胞减少，淋巴细胞比例升高的情况，患者可能会有发热、咽痛、淋巴结肿大等表现。某些细菌感染： 比如伤寒杆菌感染时，也可能出现中性粒细胞低淋巴细胞高的现象。伤寒杆菌感染人体后，会影响骨髓中中性粒细胞的生成，导致中性粒细胞数量减少，而淋巴细胞相对比例升高。
血液系统疾病相关
再生障碍性贫血： 这是一种骨髓造血功能衰竭性疾病，患者骨髓造血干细胞受损，导致中性粒细胞生成减少，而淋巴细胞等其他细胞可能相对增多。患者会有贫血、出血、感染等表现，血常规检查中就可能出现中性粒细胞低淋巴细胞高的情况。淋巴细胞白血病： 如慢性淋巴细胞白血病，骨髓中异常的淋巴细胞大量增殖，会抑制正常造血，使得中性粒细胞生成减少，同时淋巴细胞自身数量明显升高，从而出现中性粒细胞低淋巴细胞高的血象变化，患者可能有乏力、消瘦、淋巴结肿大等症状。
自身免疫性疾病影响
系统性红斑狼疮： 这是一种自身免疫性结缔组织病，在疾病活动期，免疫系统紊乱，可能会影响血细胞的生成和发育。部分患者会出现中性粒细胞降低，淋巴细胞比例相对升高的情况，患者还可能有面部红斑、关节痛、口腔溃疡等多系统受累的表现。类风湿关节炎： 活动期的类风湿关节炎患者，也可能出现中性粒细胞低淋巴细胞高的血象改变。其发病机制与自身免疫反应导致的炎症介质释放等因素有关，影响了骨髓中中性粒细胞的生成或释放。