脑萎缩目前没有能使其逆转的特效药物，但可通过一些方法延缓病情进展及改善症状。比如针对因脑血管疾病导致脑萎缩的患者，可使用改善脑循环的药物，像长春西汀等，不过具体用药需在医生指导下进行。
药物治疗方面
对症治疗药物：如果患者伴有认知功能障碍，可使用胆碱酯酶抑制剂，如多奈哌齐等，这类药物能在一定程度上改善轻至中度阿尔茨海默病型痴呆患者的认知功能。但多奈哌齐对于重度痴呆患者的疗效不明确，且可能会有恶心、呕吐等不良反应。另外，对于有精神症状的患者，若出现幻觉、妄想等，可根据情况使用抗精神病药物，如奥氮平，但要注意其可能引起的嗜睡、体重增加等副作用。
非药物干预手段
康复训练：进行认知功能训练，比如让患者每天进行一定时间的记忆训练，像回忆近期发生的事情、记住简单的数字序列等，每次训练可进行20~30分钟，每天1~2次。还可以进行运动康复，适当的有氧运动有助于改善脑的血液循环，比如散步，每周至少进行3次，每次30分钟以上，速度保持在每分钟60~100步。生活方式调整：保持健康的生活习惯很重要，要保证充足的睡眠，成年人每天应保证7~8小时的睡眠时间。饮食上要注意均衡营养，多吃富含维生素、矿物质的食物，如新鲜的蔬菜水果，每天蔬菜摄入量应达到500克左右，水果200~300克，同时要减少高脂肪、高盐食物的摄入。戒烟限酒，吸烟会增加脑血管疾病的发生风险，进而加重脑萎缩，男性每天饮酒酒精量不超过25克，女性不超过15克。
针对原发病治疗
如果脑萎缩是由甲状腺功能减退引起的，需要补充甲状腺激素，如左甲状腺素钠片。一般需要根据患者的甲状腺功能情况来调整药物剂量，初始剂量通常为每天25~50微克，然后根据血清甲状腺素水平逐渐调整，每4~6周调整一次，直到达到合适的替代剂量。而对于脑梗死导致的脑萎缩，在病情稳定后，要积极控制脑血管病的危险因素，如控制血压，将血压控制在140/90mmHg以下，如果患者有糖尿病等情况，血压可能需要控制得更严格，可降至130/80mmHg以下；控制血糖，使空腹血糖控制在4.4~7.0mmol/L，餐后血糖尽量控制在10.0mmol/L以下等。