囊肿是否要做手术不能一概而论，比如肝囊肿较小且无症状时通常不需要手术，而直径大于5厘米且有压迫症状的肝囊肿可能需要手术干预；肾囊肿直径小于4厘米且无明显症状可不做手术，直径大于4厘米伴有腰腹疼痛等症状则可能需要手术处理；卵巢囊肿如果是生理性的，一般无需手术，持续存在或直径大于5厘米的病理性卵巢囊肿可能需要手术。
肝囊肿要不要做手术
小而无症状的肝囊肿：如果肝囊肿比较小，直径小于5厘米，且没有引起任何不适症状，通常不需要做手术，定期复查超声，观察囊肿变化就行，一般建议6~12个月复查一次。大且有症状的肝囊肿：当肝囊肿直径大于5厘米，并且出现了压迫症状，比如压迫胃肠道导致腹胀、腹痛，压迫胆管引起黄疸等情况时，可能就需要考虑手术治疗，手术方式有囊肿开窗引流术等。
肾囊肿要不要做手术
小且无症状的肾囊肿：对于直径小于4厘米的肾囊肿，若没有明显症状，一般不需要做手术，每6个月左右做一次肾脏超声检查，监测囊肿大小变化。大且有症状的肾囊肿：如果肾囊肿直径大于4厘米，同时伴有腰腹部疼痛、血尿等症状，或者囊肿压迫周围组织影响肾功能时，可能需要手术治疗，常见手术方式有腹腔镜下肾囊肿去顶减压术等。
卵巢囊肿要不要做手术
生理性卵巢囊肿：很多卵巢囊肿是生理性的，比如卵泡囊肿、黄体囊肿等，一般在月经结束后会自行消失，这种情况不需要做手术，定期复查超声，观察囊肿变化即可，通常月经干净后再复查超声看看囊肿是否消失。病理性卵巢囊肿：如果卵巢囊肿持续存在，或者直径大于5厘米，考虑是病理性的，比如巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤等，这时候可能需要手术治疗，手术方式根据囊肿性质、患者年龄和生育需求等因素来选择，有卵巢囊肿剥除术等。