卵巢囊肿吃药能否消除不能一概而论，一般较小的生理性卵巢囊肿有自行消失的可能，而病理性卵巢囊肿通常吃药较难消除。比如直径小于5厘米的单纯性生理性卵巢囊肿，有一定概率在2~3个月经周期后自行消退，但这也不是绝对靠吃药消除，而是自身有消退的可能性。
生理性卵巢囊肿的情况
多数可观察： 生理性卵巢囊肿比较常见，比如滤泡囊肿和黄体囊肿，多与月经周期有关。一般直径小于5厘米的生理性卵巢囊肿，不需要特殊吃药治疗，定期复查超声即可，通常在2~3个月经周期后可能自行消失。特殊情况需注意： 如果是黄体囊肿破裂等情况引起腹痛等症状时，一般也不是靠吃药消除，而是根据具体病情采取相应治疗，如保守治疗或手术等，但这不是通过吃药让囊肿消除。
病理性卵巢囊肿的情况
卵巢巧克力囊肿： 属于子宫内膜异位症的一种，吃药很难让囊肿完全消除。常用药物如短效避孕药，可通过调节激素水平来缓解症状、控制囊肿生长，但一般不能使囊肿彻底消失。卵巢浆液性囊腺瘤等： 这类病理性卵巢囊肿通常需要手术治疗，吃药基本无法让囊肿消除。药物治疗对这类囊肿效果不佳，一般确诊后多建议手术切除。
药物对卵巢囊肿的辅助作用
辅助治疗情况： 对于一些术后预防复发等情况，可能会使用药物辅助。比如使用GnRH-a类药物，可抑制卵巢功能，减少卵巢囊肿复发的几率，但它不是让已存在的卵巢囊肿消除，而是起到预防复发的辅助作用。药物不能替代手术： 像一些较大的病理性卵巢囊肿，或怀疑有恶变可能的卵巢囊肿，药物治疗根本无法消除囊肿，必须通过手术切除，药物只是作为辅助的一种手段，不能取代手术治疗。