射精的时候疼可能由多种原因造成，比如生殖系统炎症。像附睾炎就比较常见，据临床统计，约有一定比例的男性射精疼痛与附睾炎相关。
一、生殖系统炎症引发
前列腺炎：前列腺发生炎症时，射精过程中前列腺会收缩，炎症刺激可能导致射精疼痛。患者可能还会伴有尿频、尿急等症状。精囊炎：精囊发炎后，精囊黏膜充血水肿，射精时精囊收缩，容易引起疼痛，同时可能出现血精现象。
二、结石因素导致
尿道结石：尿道内有结石存在，射精时尿液排出路径与精液排出路径有部分重合，结石可能阻碍精液排出，从而引发疼痛。输精管结石：输精管内如果有结石，射精时输精管收缩推动精液，结石会刺激周围组织，导致疼痛发生。
三、性功能相关问题
勃起功能障碍伴随：一些勃起功能障碍的患者，在射精时由于生殖器官相关肌肉等协调出现问题，可能会出现疼痛情况。性交姿势不当：不正确的性交姿势可能会对生殖器官造成过度挤压等情况，长期如此可能引发射精时疼痛，比如过于剧烈或不恰当的体位。
四、其他少见原因
肿瘤影响：像睾丸、附睾肿瘤等，肿瘤组织生长可能侵犯周围神经等组织，在射精时引发疼痛，但这种情况相对较少见。外伤后遗留：如果生殖器官曾经有过外伤，恢复后可能会有组织粘连等情况，射精时也可能出现疼痛。