如果新生儿喉咙有痰，可采取以下方式进行治疗。
1.经常改变体位：适当增加新生儿的喂奶次数，喂奶后轻轻拍打新生儿的背部，帮助排出呼吸道分泌物，使呼吸道保持通畅。
2.保持适宜的温度和湿度：室内温度最好保持在22℃至24℃，相对湿度保持在60%至65%。
3.蒸汽吸入：将沸水倒入杯子中，让新生儿口鼻对着升起的水蒸气并吸入，可使痰液稀释，缓解呼吸道黏膜的紧张状态，每次持续20分钟左右。
4.拍痰：让新生儿侧卧，家长五指稍屈，握成空手拳，由外向内轻拍宝宝的前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍击力量不宜过大，每次拍3至5分钟，每天拍2至3次。
5.药物治疗：在医生的指导下，根据具体情况选择合适的药物进行治疗，如氨溴索、乙酰半胱氨酸等。
6.及时就医：如果新生儿的症状持续不缓解或出现呼吸急促、喘息等异常情况，应及时就医，以便医生进行进一步的诊断和治疗。