一般来说，孕妇在不足三个月时坐飞机可能没有太大影响，但具体情况还需因人而异。
在怀孕早期，胚胎着床尚不稳定，孕妇的身体可能会出现一些不适，如恶心、呕吐、疲劳等。此外，飞机在上升和下降过程中，气压的变化可能会引起耳部不适，如耳鸣、耳痛等。但这些不适通常是轻微的，并且可以通过一些方法来缓解，如咀嚼口香糖、吞咽口水、捏住鼻子吹气等。
然而，对于一些特殊情况的孕妇，坐飞机可能存在一定的风险。例如：
有习惯性流产史、早产史、宫颈机能不全等病史的孕妇；
孕期出现阴道流血、腹痛、宫缩等异常情况的孕妇；
患有妊娠高血压、糖尿病、心脏病等疾病的孕妇；
怀有多胎或胎儿发育异常的孕妇。
对于这些孕妇，建议在乘坐飞机前咨询医生的意见，以确保自身和胎儿的安全。医生会根据孕妇的具体情况进行评估，并给出相应的建议。
此外，孕妇在乘坐飞机时还需要注意以下几点：
穿着舒适宽松的衣服，便于行动；
系好安全带，避免过紧；
尽量避免长时间坐着不动，可以在飞机上适当活动一下；
注意饮食卫生，避免食用不洁食物；
携带必要的药品和医疗证明；
告知机组人员自己的特殊情况，以便得到更好的照顾。
总之，孕妇在不足三个月时坐飞机是否有影响，需要综合考虑孕妇的个体情况。在做出决定之前，最好咨询医生的意见，以确保自身和胎儿的安全。同时，孕妇在乘坐飞机时也需要注意自身的健康和安全，如有任何不适，应及时寻求帮助。