同房时小腹疼可能是盆腔炎、子宫内膜异位症、宫颈炎、性交损伤等原因引起的，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.盆腔炎：女性上生殖道及其周围组织的炎症，主要包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿、盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。若发生盆腔炎也往往是邻近器官炎症的扩散。按其发病过程、临床表现可分为急性与慢性两种。
2.子宫内膜异位症：这是导致女性同房时小腹痛的常见原因之一，有数据显示，约有50%的子宫内膜异位症患者会出现性交疼痛的现象。子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜，在子宫被覆面以外的地方生长繁殖而形成的一种妇科疾病。
3.宫颈炎：这是妇科常见疾病之一，包括子宫颈阴道部炎症及子宫颈管黏膜炎症。因子宫颈管阴道部鳞状上皮与阴道鳞状相延续，阴道炎症均可引起子宫颈阴道部炎症。由于子宫颈管黏膜上皮为单层柱状上皮，抗感染能力较差，易发生感染。临床多见的子宫颈炎是急性子宫颈管黏膜炎，若急性子宫颈炎未经及时诊治或病原体持续存在，可导致慢性子宫颈炎症。
4.性交损伤：如果在同房时动作过于粗暴，或是男方用力过猛，导致女方腹部受到强烈的刺激，也可能会出现小腹疼痛的情况。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，可适当食用富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、香蕉等，避免食用辛辣、油腻、生冷等刺激性食物，如辣椒、肥肉、冰淇淋等。