脑枕部痛如果症状时发作性，持续时间数秒钟至1-2分钟，可以突然停止，可以反复发作，为跳痛或者刺痛，有可能是原发性枕大神经痛引起，进行对症治疗，口服卡马西平、苯妥英钠或者奥卡西平。
如果患者的症状为持续性可能是颈椎病所引起，颈椎病包括颈椎骨质增生、颈椎间盘突出和颈椎曲度变直，可能会引起患者颈部肌肉收缩痉挛，可以牵扯到头皮神经、血管，患者可以表现为后脑勺部位的疼痛。
如果患者有颅内器质性病变，比如后颅窝肿瘤时也可能会出现上述症状，同时患者也可能会出现躯体症状和体征，包括肢体感觉障碍、运动障碍或者头晕、平衡障碍等。
必要时检查颅脑核磁、颈椎核磁以明确诊断。