非典型肺炎的治疗需要综合多方面措施，一般来说主要通过支持治疗和针对症状的药物治疗等。例如，对于一些非典型肺炎患者，需要保证患者有充足的休息，每天保证一定的热量摄入等。
一般支持治疗
隔离与休息： 非典型肺炎患者需进行隔离，避免病毒传播给他人。同时要保证患者充分休息，一般建议每天休息时间不少于8 - 10小时，让身体有足够能量对抗疾病。呼吸支持： 如果患者出现呼吸困难等情况，可能需要通过吸氧来改善呼吸状况。轻度缺氧的患者可以通过鼻导管吸氧，维持血氧饱和度在93% - 95%左右；对于较为严重的缺氧情况，可能需要使用面罩吸氧甚至是无创呼吸机辅助通气等。
药物治疗方面
抗病毒药物： 目前对于非典型肺炎可能会使用一些抗病毒药物，如利巴韦林等。利巴韦林具有广谱抗病毒作用，能抑制病毒核酸的合成。但使用时要注意其可能存在的副作用，比如对血液系统的影响，可能会引起贫血等情况，所以用药过程中需要密切监测血常规等指标。糖皮质激素： 在病情较为严重，如出现明显的急性肺损伤等情况时，可能会考虑使用糖皮质激素。例如甲泼尼龙，使用时要严格掌握剂量和疗程。一般初始剂量可能根据患者体重等情况给予一定剂量，如1 - 2mg/(kg·d)，然后根据患者病情变化逐渐调整剂量。但使用糖皮质激素可能会带来一些副作用，如感染风险增加、骨质疏松等，所以需要谨慎评估使用。
并发症防治
预防继发感染： 非典型肺炎患者由于身体抵抗力下降，容易发生继发细菌感染。需要密切观察患者情况，如出现咳嗽加重、咳黄痰、发热持续不退等可能继发细菌感染的表现时，可能需要使用抗生素。一般会根据经验先选用广谱抗生素，如头孢曲松等，后续再根据痰培养等结果调整抗生素使用。器官功能维护： 如果患者出现肝肾功能损害等并发症，需要进行相应的维护。对于肝功能损害，可能需要使用一些保肝药物，如多烯磷脂酰胆碱等；对于肾功能损害，要注意维持水电解质平衡，必要时可能需要进行肾脏替代治疗等。