女性雌激素低可能由多种原因引起。一般来说，年龄是一个重要因素，女性在40~50岁左右进入围绝经期，体内雌激素水平会逐渐下降，约有1/3的女性可能出现较明显的雌激素低的情况。
生理因素导致
卵巢功能衰退： 随着年龄增长，卵巢功能会自然衰退，卵泡数量减少，分泌雌激素的能力下降。比如，女性到了围绝经期，卵巢储备的卵泡耗尽，雌激素分泌量会显著降低。垂体疾病影响： 垂体是调节内分泌的重要器官，如果垂体发生病变，如垂体瘤等，会影响促性腺激素的分泌，进而影响卵巢分泌雌激素，导致雌激素水平降低。
生活方式因素
长期熬夜： 长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常调节。有研究发现，长期熬夜的女性，体内雌激素分泌可能会出现紊乱，导致雌激素水平降低。过度节食： 女性过度节食会使身体摄入的营养物质不足，尤其是蛋白质、脂肪等摄入不够，而这些营养物质是合成雌激素的重要原料。当原料缺乏时，雌激素的合成就会减少，长期如此会导致雌激素水平低下。
疾病因素
甲状腺疾病： 甲状腺功能减退会影响甲状腺激素的分泌，而甲状腺激素与雌激素的代谢密切相关。当甲状腺功能减退时，可能会间接导致雌激素水平降低。例如，甲状腺激素分泌不足会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，从而影响雌激素的分泌。自身免疫性疾病： 像系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，免疫系统会错误地攻击自身的组织器官，包括卵巢组织，破坏卵巢细胞，影响雌激素的分泌，导致雌激素水平低下。