长智齿疼主要与智齿萌出受阻、周围组织感染等因素有关。
一、智齿萌出空间不足
智齿是人类口腔内牙槽骨上最里面的第三颗磨牙，部分人颌骨发育空间不够，智齿萌出时没有足够位置，会受到邻牙、骨组织等的阻碍，在萌出过程中就容易引发疼痛。比如一些人的颌骨比较短小，智齿萌出时没有足够空间展开，就会出现局部胀痛等情况。
二、智齿冠周炎
智齿萌出过程中，牙冠周围的牙龈组织容易被细菌感染，引发智齿冠周炎。细菌在局部大量繁殖，刺激牙龈组织，导致牙龈红肿、疼痛，严重时还可能伴有张口受限、发热等症状。例如智齿部分萌出，牙龈瓣与牙冠之间形成较深的盲袋，食物残渣容易嵌塞在盲袋内，为细菌滋生创造了条件，从而引发炎症导致疼痛。
三、邻牙受累
智齿生长过程中可能会对相邻的牙齿造成影响，比如压迫邻牙，导致邻牙出现龋坏、牙根吸收等问题，进而引起疼痛。对于一些本身牙齿健康状况不佳的人，智齿的生长更容易诱发邻牙的病变，从而产生疼痛不适。
四、个体差异因素
不同个体对智齿萌出的反应不同，有些人智齿萌出时可能没有明显疼痛，但有些人则会因为自身的生理状况等因素，如免疫力相对较低时，更容易出现智齿相关的疼痛问题。比如女性在生理期等特殊时期，身体抵抗力下降，智齿疼痛可能会相对更明显。