紫河车可能存在一些副作用，比如可能引起过敏反应，部分人使用后会出现皮肤瘙痒、皮疹等表现；还可能影响消化系统，导致恶心、呕吐等不适；另外，对于一些特殊人群，如患有某些基础疾病者，可能会因个体差异出现其他不良情况。
过敏反应方面
部分人属于过敏体质，对紫河车中的某些成分敏感，使用后免疫系统被激活，引发过敏反应。轻者皮肤出现红斑、风团样改变，伴有瘙痒；重者可能出现呼吸困难等严重过敏症状。
消化系统影响
紫河车进入人体后，可能对胃肠道产生刺激，影响胃肠正常的消化功能，导致恶心、呕吐等症状，尤其是本身胃肠功能较弱的人群，这种不适可能更为明显。
特殊人群风险
对于患有高血压、糖尿病等慢性疾病的人群，紫河车的使用可能会干扰体内的代谢平衡或血压、血糖的稳定，因为其成分可能会对相关生理指标产生影响，需谨慎使用。
其他潜在问题
由于紫河车来源复杂，可能存在携带病原体的风险，若处理不当或个体抵抗力较低时，可能引发感染性疾病等问题。同时，长期或过量使用紫河车也可能给身体带来额外的代谢负担，影响肝肾功能等正常生理功能。