矮小症检查费用贵不贵，需要根据具体情况而定。一般来说，矮小症的检查费用包括以下几个方面：
1.常规检查：如身高、体重、骨龄测定、甲状腺功能等，这些检查费用相对较低，一般在几百元到一千元左右。
2.激发试验：如果常规检查不能明确病因，可能需要进行激发试验，如生长激素激发试验、胰岛素样生长因子-1测定等，这些检查费用较高，一般在数千元左右。
3.其他检查：如果怀疑存在其他疾病，如染色体异常、先天性肾上腺皮质增生症等，可能需要进行相关检查，费用则会更高。
此外，检查费用还与医院的级别、地区差异、检查项目的多少等因素有关。需要注意的是，矮小症的治疗费用也较高，需要长期治疗，因此，建议家长在发现孩子身高异常后，及时带孩子到正规医院就诊，进行全面的检查和评估，以便制定合理的治疗方案。同时，家长也可以咨询医保部门，了解相关的报销政策，减轻经济负担。