怀孕41天通常能通过B超看到胚芽。胚芽是胎儿发育的早期阶段，在怀孕5-6周时，B超可以检测到胚芽和原始心管搏动，确定宫内妊娠和孕周。
需要注意的是，每个女性的月经周期和受孕时间可能不同，因此看到胚芽的时间也会有所差异。如果受孕时间较晚，可能需要等待更长时间才能看到胚芽。
此外，B超检查还可以排除宫外孕、葡萄胎等异常情况，同时观察孕囊的大小、形态和位置，评估胚胎的发育情况。
如果怀孕41天还看不到胚芽，医生可能会建议进行进一步的检查，如血HCG检测、孕酮测定等，以了解胚胎的发育情况。如果这些检查结果异常，可能需要采取相应的治疗措施。
在等待B超检查的过程中，孕妇应保持良好的心态，注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医。
需要强调的是，以上内容仅供参考，具体情况请以医生的诊断为准。