精神分裂症的病因目前尚未完全明确，但有多种因素相互作用可能导致其发生。一般认为遗传因素在其中起到重要作用，据研究，遗传因素在精神分裂症发病中约占60%~80%。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有精神分裂症，那么其他家族成员患该病的风险会高于普通人群。例如，父母一方患有精神分裂症，子女患病的概率约为10%左右；父母双方都患病时，子女患病概率可高达40%左右。基因层面影响： 目前已经发现多个与精神分裂症相关的基因位点，这些基因会影响大脑的发育、神经递质的功能等，从而增加患精神分裂症的易感性。
大脑结构和功能异常方面
大脑结构改变： 一些研究发现，精神分裂症患者的大脑在结构上存在异常，比如脑室扩大，脑皮质变薄等。例如，通过脑部影像学检查可以观察到患者大脑某些区域的体积与正常人不同，颞叶、额叶等部位可能出现体积减小的情况。神经递质紊乱： 大脑中的神经递质如多巴胺、谷氨酸等的平衡失调与精神分裂症密切相关。多巴胺功能亢进假说认为，大脑中多巴胺系统功能异常，尤其是中脑 - 边缘系统和中脑 - 皮质系统的多巴胺功能亢进，可能导致幻觉、妄想等阳性症状的出现；而谷氨酸系统功能不足也可能参与了精神分裂症的发病过程，影响神经信息的传递和大脑的正常功能。
环境因素方面
孕期和围产期因素： 母亲在孕期如果遭受病毒感染，如风疹病毒感染等，可能会增加胎儿患精神分裂症的风险。另外，围产期出现并发症，如早产、难产、新生儿窒息等，也可能对胎儿的大脑发育产生不良影响，从而增加日后患精神分裂症的可能性。社会心理因素： 长期处于高压力的生活环境中，如工作压力过大、生活中遭遇重大挫折等，可能会诱发精神分裂症。例如，一些人在经历亲人离世、失业等重大生活事件后，出现精神分裂症症状的风险会有所升高。还有不良的家庭环境，如家庭关系紧张、缺乏温暖和支持等，也可能对精神分裂症的发生起到促进作用。