三个月宝宝大便有粘液和血丝，可能是以下原因引起：
1.肛裂：宝宝肛门周围皮肤薄嫩，血管丰富，若用力排便，可能导致肛裂，出现大便带血，同时伴有肛门疼痛。
2.直肠息肉：直肠息肉是小儿便血的常见原因，多见于3岁至6岁儿童。为单个或多个带蒂的肿物，颜色鲜红，通常便后出血。
3.内痔：若宝宝患有内痔，也可能出现大便带血，通常为鲜红色，不与大便混合。
4.感染：宝宝肠道感染，如细菌、病毒、真菌等引起的肠炎，也可能导致大便带血，同时可能伴有腹泻、腹痛、呕吐等症状。
5.其他：如食物过敏、肠道畸形、血液系统疾病等也可能导致宝宝大便带血。
如果发现三个月宝宝大便有粘液和血丝，建议及时就医，进行相关检查，如大便常规、血常规、肠镜等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持宝宝肛门清洁，及时更换尿布，避免感染。