月经结束后小腹疼痛，可能是盆腔炎、子宫内膜异位症等妇科疾病引起的，也可能是其他疾病的症状。以下是一些可能的原因：
1.盆腔炎：女性生殖系统有自然的防御功能，在正常情况下，能抵御细菌的入侵，只有当机体的抵抗力下降，或由于其他原因使女性的自然防御功能遭到破坏时，才会导致盆腔炎的发生。盆腔炎是指女性盆腔生殖器官、子宫周围的结缔组织及盆腔腹膜的炎症。慢性盆腔炎往往是急性期治疗不彻底迁延而来，因其发病时间长，病情较顽固，外阴部的细菌可以逆行感染，通过子宫、输卵管而到达盆腔。但在现实生活中，并不是所有的妇女都会患上盆腔炎，发病只是少数。这是因为女性生殖系统有自然的防御功能，在正常情况下，能抵御细菌的入侵，只有当机体的抵抗力下降，或由于其他原因使女性的自然防御功能遭到破坏时，才会导致盆腔炎的发生。
2.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，称为子宫内膜异位症。这种异位的内膜在组织学上不但有内膜的腺体，且有内膜间质围绕；在功能上随雌激素水平而有明显变化，能产生少量“月经”而引起种种临床现象。患者如受孕，异位内膜可有蜕膜样改变。这种异位内膜虽在其他组织或器官内生长，但有别于恶性肿瘤的浸润。子宫内膜异位症多发生于生育年龄的女性，青春期前不发病，绝经后异位病灶可逐渐萎缩退化。
3.其他：月经结束后小腹疼痛还可能与其他疾病有关，如肠炎、肠痉挛、腹部受凉等。
总之，月经结束后小腹疼痛可能是多种疾病的症状之一，如果疼痛持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。