肛门分泌物发黄很臭可能是由多种原因引起的，比如肛瘘，肛瘘患者的瘘管内会有脓性分泌物渗出，一般持续时间较长，有的数月甚至数年不愈。
一、肛瘘导致的情况
肛瘘形成原因： 大多是肛门直肠周围脓肿破溃或切开引流后遗留的后遗症。肛门腺感染是主要病因，细菌侵入肛门腺后，感染蔓延形成脓肿，破溃后就容易形成肛瘘。分泌物特点： 肛瘘患者的肛门会间断或持续流出少量脓性、血性、黏液性分泌物，这些分泌物颜色发黄且有臭味，有时会污染内裤，局部还可能伴有潮湿、瘙痒等症状。
二、直肠炎引发的状况
直肠炎诱因： 感染（细菌、病毒、寄生虫等感染）、放疗、炎症性肠病等都可能导致直肠炎。比如细菌性直肠炎，多是由于食用了被细菌污染的食物引起。分泌物表现： 直肠炎患者的直肠黏膜会出现炎症反应，分泌增多，从而导致肛门有黄色、发臭的分泌物排出，同时可能伴有直肠出血、里急后重（有便意但排不出多少）、腹痛等症状。
三、肛门湿疹造成的情形
肛门湿疹原因： 内部因素如消化不良、肠道寄生虫、内分泌失调等，外部因素如内裤材质不适、局部摩擦、接触过敏原等都可能引发肛门湿疹。例如对某些化纤材质的内裤过敏就可能导致肛门湿疹。分泌物情况： 肛门湿疹患者局部会有丘疹、水疱等皮疹，搔抓后容易破溃渗出，渗出液干燥后就会形成发黄且有臭味的分泌物，同时伴有剧烈瘙痒，患者常忍不住搔抓，进一步加重症状。