长期吃避孕药可能会带来一些健康方面的影响。一般来说，长期服用避孕药可能增加某些疾病的发生风险等。
对月经的影响
经期紊乱：部分女性长期吃避孕药后可能出现月经周期改变，比如原本规律的月经变得提前或推迟。有的女性会出现月经量减少，大约有10% - 20%的女性可能出现这种情况；也有少数人会出现月经量增多的现象。突破性出血：在服药过程中，有些女性可能会出现非经期的突破性出血，尤其是服药初期比较常见，不过一般随着服药时间延长会逐渐改善，但也有少数人会持续存在。
对代谢的影响
体重变化：有研究发现，长期吃避孕药可能会影响体重，大约有5% - 10%的女性可能会出现体重增加的情况，这可能与避孕药影响体内水钠代谢以及脂肪代谢有关；不过也有部分女性体重没有明显变化。血脂影响：长期服用某些类型的避孕药可能会使血脂发生变化，比如可能导致低密度脂蛋白升高，高密度脂蛋白降低，不过这种影响因人而异，一般停药后部分指标可逐渐恢复，但长期异常可能增加心血管疾病潜在风险。
对健康的潜在长期风险
血栓风险：长期吃避孕药会略微增加静脉血栓形成的风险，虽然总体风险不高，但对于有吸烟习惯、年龄较大（35岁以上）、有静脉曲张等情况的女性，风险相对更高。据统计，长期服用复方口服避孕药的女性，静脉血栓形成的风险比不服用者高2 - 4倍。乳腺癌相关争议：有一些研究观察到长期服用避孕药可能与乳腺癌发病风险有一定关联，但这种关联比较复杂，目前还存在不同观点，不过总体来说风险增加幅度相对较小。