丘脑脑梗死的后遗症，最多见的是病人以感觉障碍为主。因为丘脑是感觉的中继站，发生病变后病人可以出现肢体麻木、疼痛、蚁行感以及刺痛，严重时病人还可以出现患侧肢体的自发性疼痛。
丘脑后遗症导致的感觉障碍，必要时可以给予病人中药的活血、通络药物，比如有水蛭和地龙成分的中成药，临床上常用的有蛭蛇通络胶囊、复方地龙胶囊等。
丘脑脑梗死的后遗症还可以见于中风、焦虑状态，也是由于丘脑感觉异常导致病人出现中风、焦虑、抑郁。必要时可以给予病人口服改善焦虑、抑郁情绪的药，临床上常用的有黛力新、百忧解以及草酸艾司西酞普兰等。