半夜发烧可能由多种原因引起，比如感染性因素，像病毒、细菌等病原体感染都可能导致半夜发烧。据统计，约60%的半夜发烧是由感染引起的。
感染性因素导致半夜发烧
病毒感染：
病毒感染是常见原因，例如上呼吸道病毒感染。像流感病毒引起的流感，就常常会导致半夜发烧，还可能伴有咳嗽、鼻塞、流涕等症状。另外，普通感冒病毒感染也可能引发半夜发烧，一般病程可能持续3 - 7天。
细菌感染：
细菌感染也会造成半夜发烧，比如肺炎链球菌引起的肺炎，除了发烧，还可能出现咳嗽、咳痰、胸痛等症状。还有尿路感染时，细菌感染也可能导致半夜发烧，同时可能有尿频、尿急、尿痛等表现。
非感染性因素导致半夜发烧
自身免疫性疾病：
一些自身免疫性疾病也会出现半夜发烧的情况，比如系统性红斑狼疮，除了发烧，还可能有面部红斑、关节疼痛等症状。类风湿关节炎也可能在半夜出现发烧，同时伴有关节肿胀、疼痛、畸形等表现。
恶性肿瘤：
某些恶性肿瘤也可能引起半夜发烧，例如白血病，除了发烧，还可能有贫血、出血、肝脾淋巴结肿大等症状。肝癌、肺癌等实体肿瘤晚期也可能出现癌性发热，导致半夜发烧。
环境因素：
环境温度过高或穿着过厚也可能导致半夜发烧。比如室内温度过高，睡觉时盖被过厚，身体散热不良就可能引起体温升高，这种情况调整环境温度和穿着后，体温通常会恢复正常。