附件囊肿的药物治疗需根据具体情况而定，一般来说，生理性附件囊肿可能无需特殊用药，而病理性附件囊肿可能会用到一些药物，比如避孕药等，但具体用药需遵医嘱。通常没有所谓“吃什么药最有效”的绝对说法，要根据囊肿性质等综合判断。
生理性附件囊肿的情况
多数无需药物干预： 部分附件囊肿是生理性的，比如卵泡囊肿或黄体囊肿，一般在月经周期变化中会自然消失，通常不需要吃药。一般这种生理性囊肿会在月经来潮后缩小或消失，无需特殊处理。观察为主： 对于直径小于5厘米的生理性附件囊肿，通常建议定期（一般间隔1 - 3个月）进行超声复查，观察囊肿变化情况。
病理性附件囊肿的药物辅助情况
避孕药的应用： 对于一些子宫内膜异位症相关的附件囊肿，可能会使用短效避孕药。短效避孕药可以调节激素水平，抑制子宫内膜异位病灶的生长，从而对相关附件囊肿有一定的控制作用。但使用避孕药需要在医生指导下进行，并且要注意其可能的副作用，如恶心、呕吐、月经紊乱等。其他药物： 一些情况下可能会用到GnRH - a类药物，这类药物可以抑制卵巢功能，使雌激素水平下降，达到药物性卵巢切除的作用，从而使附件囊肿缩小。不过这类药物有一定的副作用，如骨质疏松等风险，使用时需谨慎评估。
特殊人群用药注意
育龄女性： 育龄女性如果患有附件囊肿需要用药时，要考虑对生育的影响。比如使用避孕药时，要了解其对后续怀孕可能产生的影响；使用GnRH - a类药物时，要知晓停药后卵巢功能恢复的时间等情况，在医生综合评估后选择合适药物。绝经后女性： 绝经后女性出现附件囊肿，用药需更加谨慎。一般首先要排除恶性病变可能，药物治疗相对较少，更多是根据囊肿具体情况考虑手术等治疗方式，药物使用需严格遵循医生针对绝经后特殊生理状态制定的方案。