骨穿刺主要是为了获取骨髓液进行检查，帮助诊断血液系统疾病等。一般来说，通过骨穿刺可以检查骨髓中的细胞形态、成分等情况。
用于诊断血液系统疾病
白血病的辅助诊断： 骨穿刺能观察骨髓中白血病细胞的数量和形态，比如急性白血病患者的骨髓中会有大量异常的原始和幼稚细胞，通过骨穿刺可以明确诊断白血病的类型，像急性淋巴细胞白血病和急性髓系白血病等不同类型在骨髓象上有不同表现。贫血的鉴别诊断： 对于贫血患者，骨穿刺可以查看骨髓中造血细胞的情况。例如缺铁性贫血患者的骨髓中铁粒幼细胞减少；而巨幼细胞贫血患者骨髓中会出现巨幼样变的红细胞等，帮助医生区分是哪种原因导致的贫血。
诊断感染性疾病
伤寒的辅助诊断： 在伤寒病程中，骨髓中的细菌培养阳性率比血液培养高。通过骨穿刺进行骨髓细菌培养，有助于明确伤寒杆菌的感染情况，对伤寒的诊断和病情监测有重要意义。疟疾的诊断： 疟原虫在骨髓中较易找到，所以骨穿刺涂片检查疟原虫对于疟疾的确诊有重要价值，尤其是对临床高度怀疑疟疾但血液涂片阴性的患者。
诊断其他疾病
多发性骨髓瘤的诊断： 骨穿刺可以发现骨髓中的骨髓瘤细胞，同时还能观察到骨髓中浆细胞的比例异常等情况，结合其他检查可以诊断多发性骨髓瘤，并评估病情的严重程度。骨髓增生异常综合征的诊断： 骨穿刺能看到骨髓中造血细胞的病态造血现象，如红细胞、粒细胞、巨核细胞等的形态异常，帮助医生诊断骨髓增生异常综合征，并判断疾病的分期等情况。