三岁宝宝总眨眼睛可能是以下原因所致：
1.眼表炎症：如结膜炎、角膜炎等，可能导致眼睛红肿、疼痛、异物感，从而引起眨眼。
2.过敏性结膜炎：宝宝接触过敏原后，可能会出现眼部瘙痒，进而频繁眨眼。
3.倒睫：睫毛向后方生长，刺激角膜和结膜，引起眨眼、流泪等症状。
4.抽动症：这是一种神经精神障碍性疾病，患儿可出现频繁眨眼、皱眉、咧嘴、耸肩等不自主的动作。
5.不良习惯：宝宝模仿他人眨眼，或长时间看电视、手机等，可能导致眨眼习惯。
6.视力问题：近视、远视、散光等屈光不正，或用眼过度导致的视疲劳，也可能引起眨眼。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.保持眼部清洁，避免感染。
2.避免宝宝接触过敏原。
3.如果是倒睫，可在医生指导下拔除或电解睫毛。
4.对于抽动症，需要及时就医，进行心理行为治疗和药物治疗。
5.培养宝宝良好的用眼习惯，避免长时间用眼。
6.及时带宝宝到眼科就诊，进行视力检查和屈光矫正。
在治疗期间，家长应注意观察宝宝的眨眼情况，避免宝宝过度用眼，可适当食用富含维生素A的食物，如胡萝卜、鱼肝油等，避免食用辛辣、刺激性食物。