肛瘘不做手术一般不可以自愈，而且肛瘘可能会反复发作，因此肛瘘一旦确诊，建议手术治疗。
肛瘘是肛管或直肠与会阴皮肤相通的肉芽肿性管道，主要侵犯肛管，很少涉及直肠，故常称为肛瘘，中医称为肛漏。其病因主要与肛管或直肠周围脓肿有关，多数是由于肛管直肠周围脓肿破溃后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，外部破溃口和切口也缩小，腔壁形成结缔组织增生的坚硬管道，致使分泌物不易排出，容易反复发作，经久不愈。少数肛瘘为结核分枝杆菌、放线菌感染所形成，与普通细菌感染的肛瘘在治疗方法上有所不同。
肛瘘的治疗方法主要是肛瘘切除术和肛瘘切开术。肛瘘切除术是将瘘管及其周围组织一并切除，适用于低位单纯性肛瘘。肛瘘切开术是将瘘管切开，使其引流通畅，适用于高位肛瘘或低位复杂性肛瘘。手术治疗的目的是彻底清除肛瘘内口和瘘管，以避免肛瘘的复发。
总之，肛瘘是一种需要手术治疗的疾病，不做手术一般不可以自愈，而且肛瘘可能会反复发作，严重影响患者的生活质量。因此，建议肛瘘患者及时就医，在医生的指导下选择合适的治疗方法。