反复咳嗽发烧可能由多种原因引起。一般来说，呼吸道感染是常见因素，比如儿童反复咳嗽发烧，多数是病毒或细菌感染了上呼吸道或下呼吸道导致。像病毒性感冒引起的反复咳嗽发烧，病程可能持续3 - 7天左右，但如果是细菌感染引发的肺炎，病程可能会更长。
常见病因分类
感染性病因：
病毒感染： 例如流感病毒，它会引起高热，体温可达到39℃甚至更高，同时伴有剧烈咳嗽、头痛、全身酸痛等症状。还有普通的鼻病毒感染，也会导致咳嗽、低烧，一般体温在37.5℃ - 38.5℃之间波动，咳嗽多为刺激性干咳。细菌感染： 肺炎链球菌感染引发的肺炎，除了反复高烧，体温可达39℃ - 40℃，还会有咳嗽、咳脓痰等表现。溶血性链球菌引起的扁桃体炎，也会出现反复发烧，体温38℃左右，同时伴有剧烈咽痛、咳嗽，扁桃体充血肿大。
非感染性病因：
自身免疫性疾病： 比如幼年特发性关节炎，除了关节症状外，也可能出现反复低热，同时伴有咳嗽，这种咳嗽一般是慢性咳嗽，程度相对较轻。系统性红斑狼疮也可能有反复低热、咳嗽的情况，还会有面部红斑等其他表现。气道异物： 如果儿童有反复咳嗽发烧的情况，要考虑气道异物的可能。比如孩子误将小颗粒食物吸入气道，会反复出现刺激性咳嗽，并且伴有低热，这种情况通过胸部CT等检查可协助诊断。过敏因素： 过敏性鼻炎合并哮喘时，会出现反复咳嗽，多为刺激性干咳，同时可能伴有低热，接触过敏原后症状加重，比如接触花粉、尘螨等。
其他因素：
环境因素： 长期处于污染的环境中，空气中的有害颗粒刺激呼吸道，也会引起反复咳嗽，可能伴有轻度发热。比如在雾霾天气较多的地区，有些人会出现反复咳嗽、低热的情况。温度变化： 孩子穿衣过少，受凉后容易出现反复咳嗽发烧，尤其是在季节交替时，气温变化大，孩子体温调节能力不完善，就容易受影响。