同仁堂清脑丸具有清热解毒、活血通络的作用，用于治疗由热毒内盛、风火上攻所导致的头痛，缓解头部胀痛、刺痛、跳痛，或头晕、目眩、视物旋转、耳鸣口苦、心烦易怒、舌红苔黄、脉弦数等症状。
同仁堂清脑丸是一种纯中药制剂，主要成分包括黄连、黄芩、黄柏、大黄、桅子、川芎、白芷、羌活、防风、荆芥穗、薄荷、茶叶、菊花、蔓荆子（炒）、连翘、藁本、葛根、石膏、滑石、人工牛黄、冰片等。其中，黄连、黄芩、黄柏、大黄清热解毒，桅子清热泻火，川芎、白芷、羌活、防风、荆芥穗、薄荷、茶叶、菊花、蔓荆子、连翘、藁本、葛根疏散风热、清利头目，石膏清热泻火，滑石利水通淋，人工牛黄清热解毒、息风止痉、化痰开窍，冰片清热解毒、止痛开窍。诸药合用，共奏清热解毒、活血通络之功。