一、生长速度
良性肿瘤：生长速度通常较慢，可数年甚至数十年无明显变化。例如一些皮下的脂肪瘤，可能在数年内大小变化不显著，其细胞增殖相对有序，受机体调控较为稳定。对于儿童的良性肿瘤，如颅咽管瘤，虽然会随着时间增长，但一般进展相对缓慢，与机体的生长发育节奏有一定关联，不过总体增殖速度低于恶性肿瘤。
恶性肿瘤：生长速度往往较快，短期内可明显增大。像肺癌患者，肺部的恶性肿瘤可能在几个月内就会观察到体积明显增大，癌细胞增殖失控，不受正常机体调控机制的有效约束，迅速占据空间并消耗机体营养等资源。在儿童恶性肿瘤中，如神经母细胞瘤，病情进展可能较为迅猛，需及时干预治疗。
二、生长方式
良性肿瘤：多呈膨胀性生长，往往有包膜形成，与周围组织界限清楚，通常可以推动。比如肝血管瘤，瘤体周围有完整包膜，像被包裹起来一样，与周围肝组织分界清晰，一般不会侵犯周围组织，只是对周围组织产生挤压作用。在女性的子宫肌瘤中，多数也是膨胀性生长，有相对独立的边界，根据其位置和大小可能会引起月经改变等症状，但一般不会像恶性肿瘤那样浸润周围组织。
恶性肿瘤：多呈浸润性生长，没有包膜或包膜不完整，与周围组织分界不清，通常不能推动，还会侵犯周围组织、器官。例如乳腺癌，癌细胞会像树根长入泥土一样浸润周围乳腺组织以及胸壁等结构，与周围正常组织无明显界限，容易发生转移扩散。儿童的恶性肿瘤如横纹肌肉瘤，也会浸润周围肌肉等组织，破坏正常组织结构和功能。
三、组织学形态
良性肿瘤：细胞分化程度高，与起源组织的正常细胞形态相似。以纤维瘤为例，瘤细胞形态和排列与正常纤维细胞比较接近，细胞核形态正常，大小、染色均匀，核分裂象少见甚至无。对于儿童的良性肿瘤，如视网膜母细胞瘤的某些良性阶段，细胞分化也相对较好，与正常视网膜细胞有一定相似性，但随着病情发展可能向恶性转化。
恶性肿瘤：细胞分化程度低，异型性明显，与起源组织的正常细胞形态差异大。癌细胞核大小、形态不一，染色深，核分裂象多见，可见病理性核分裂象。比如低分化的胃癌细胞，与正常胃黏膜细胞相比，形态差异显著，细胞大小不等，核质比例失调等。在儿童恶性血液系统肿瘤如急性淋巴细胞白血病中，白血病细胞形态异型性明显，与正常淋巴细胞形态有很大区别，这也是诊断和分型的重要依据。
四、对机体的影响
良性肿瘤：主要是局部压迫和阻塞作用，一般对机体影响较小，除非肿瘤生长部位特殊。例如长在颅内的良性肿瘤，如垂体腺瘤，若体积逐渐增大，可能会压迫垂体及周围组织，引起内分泌紊乱等症状，但通过手术等治疗后预后较好，对机体的长期危害相对有限。对于特殊年龄段人群，如孕妇的子宫肌瘤，若肌瘤较大可能会影响分娩过程，需要根据具体情况评估处理，但总体来说良性肿瘤对机体的危害程度相对恶性肿瘤低。
恶性肿瘤：除了局部压迫、阻塞外，还会破坏组织、器官的结构和功能，晚期常出现恶病质，严重影响机体健康甚至危及生命。恶性肿瘤会广泛转移，转移到不同器官会引起相应器官的功能障碍。比如肺癌转移到脑部，会导致头痛、呕吐、偏瘫等神经系统症状；转移到骨骼会引起骨痛、骨折等。在儿童恶性肿瘤中，晚期患儿往往身体极度消瘦、乏力，机体抵抗力严重下降，多个器官功能可能受到严重破坏，生存质量极差。
五、转移
良性肿瘤：一般不转移。但少数特殊部位的良性肿瘤在一定条件下可能有局部侵袭倾向，不过不会像恶性肿瘤那样通过淋巴道、血道等途径转移到身体其他部位。例如肝局灶性结节性增生，通常不会转移到身体远处器官。
恶性肿瘤：可通过淋巴道转移、血道转移、种植性转移等方式转移到身体其他部位。淋巴道转移如乳腺癌常转移至腋窝淋巴结等；血道转移常见于肺癌转移到脑、骨等部位，肝癌转移到肺等；种植性转移如胃癌种植到腹膜等部位。儿童恶性肿瘤也存在转移情况，如骨肉瘤易转移至肺等部位，需要严密监测有无转移发生以便及时治疗。