HPV持续感染后，一般需要数年甚至数十年才有可能发展为癌变，但具体时间因人而异。通常来说，大约有10% - 15%的高危型HPV持续感染2年以上的女性，有较大可能进展为宫颈上皮内瘤变，而其中一小部分可能在10 - 15年后发展为宫颈癌。
感染亚型与癌变风险
高危亚型差异： 高危型HPV中的16型、18型等致癌性较强。如果是16型或18型HPV持续感染，相对其他高危亚型更易较快进展。比如研究发现，16型HPV持续感染的患者，在5 - 10年内发生高级别宫颈病变的风险更高。而像31型、33型等相对致癌性稍低，但也不可掉以轻心，持续感染也可能在较长时间后引发病变。低危亚型特点： 低危型HPV一般不会直接引发癌变，但可能会引起生殖器疣等病变。不过如果低危型HPV合并高危型HPV持续感染，就会增加癌变的风险概率。
个体免疫状况影响
免疫力正常人群： 对于免疫力正常的人来说，身体的免疫系统有一定的清除能力。大约80%的HPV感染能够在1 - 2年内被自身免疫系统清除掉。只有少数免疫力相对较弱或者持续受到HPV感染刺激的人，才会出现持续感染进而向癌变发展的情况。例如，年轻人免疫系统功能较强，HPV清除率相对更高，持续感染后进展为癌变的时间往往更长。免疫力低下人群： 像患有艾滋病等免疫缺陷疾病的人，或者长期使用免疫抑制剂的人，他们的免疫系统无法有效清除HPV，HPV持续感染的时间会大大延长，进而进展为癌变的时间会明显缩短。比如艾滋病患者，HPV持续感染后可能在几年内就会出现严重的宫颈病变甚至癌变。
其他相关因素影响
吸烟影响： 吸烟会降低人体的免疫力，还会影响身体对HPV的清除能力。有研究表明，吸烟的人HPV持续感染的概率比不吸烟的人高，而且吸烟会加速HPV持续感染向癌变发展的进程。每天吸烟超过10支的女性，HPV持续感染后发生宫颈病变的风险比不吸烟女性高2 - 3倍。性行为因素： 过早开始性行为、多个性伴侣等性行为因素也会增加HPV持续感染以及癌变的风险。有多个性伴侣的女性接触不同HPV亚型的机会增加，更容易出现HPV持续感染，进而可能更快发展为癌变。比如16岁前开始性行为的女性，相比25岁后开始性行为的女性，HPV持续感染后癌变的几率更高。