一、内分泌因素
卵巢是产生卵子并排卵、分泌内分泌激素、平衡内分泌的重要器官，卵巢囊肿多发生于内分泌旺盛的生育年龄，这提示内分泌变化可能与卵巢囊肿的形成有关。
二、生活方式因素
长期的饮食结构不合理、高胆固醇饮食、长期精神压力过大等生活方式因素，会影响机体的内分泌调节，增加卵巢囊肿的发病风险。
三、环境因素
食物的污染，如蔬菜等使用的植物生长激素，家畜家禽等配方饲养中瘦肉精类的激素成分，都可能与卵巢囊肿的发病相关。另外，电离辐射、石棉、滑石粉等环境因素也可能影响卵母细胞而增加诱发卵巢囊肿的机会。
四、遗传因素
据统计，20% - 25%的卵巢囊肿患者有家族史，遗传因素在卵巢囊肿的发病中也起到一定作用。