小孩灌肠和输液不能简单说哪个绝对好，需根据具体病情等情况判断。一般来说，轻度感染等情况可能优先考虑相对温和的方式，但若病情较重可能输液更能及时控制。
适用病情差异
轻度消化道感染：如果小孩是轻度的肠道病毒感染引起的腹泻等，症状较轻，精神状态好，没有严重脱水等情况，可能灌肠给药相对更方便，药物可通过直肠黏膜吸收起到一定治疗作用，比如使用一些清热解毒的中药灌肠液，可能在一定程度上缓解症状，但通常作用相对较局限。重度感染或脱水：当小孩出现严重细菌感染，比如肺炎合并败血症，或者出现严重脱水、电解质紊乱时，输液能更快速地补充水分、电解质以及输入抗生素等药物，能及时纠正内环境紊乱和控制感染，因为输液可以让药物更快进入血液循环，起效更迅速，像严重的肺炎支原体感染导致高热不退且伴有明显脱水表现时，输液输入阿奇霉素等药物并补充液体就很必要。
对小孩身体影响不同
灌肠的影响：灌肠操作如果操作不当，可能会损伤直肠黏膜，而且药物吸收相对输液来说可能不够稳定和迅速。另外，小孩直肠血管丰富，药物吸收快但也可能带来一些未知的潜在风险，比如药物过量吸收等情况。不过合理规范的灌肠在合适病情下是安全可行的。输液的影响：输液可能会有静脉炎等风险，比如长期输液或者穿刺不当可能引起局部静脉炎症，但现在医疗操作中会尽量规范穿刺等减少这类风险。不过输液是通过静脉给药，药物直接进入血液，对于病情较重需要快速治疗的情况优势明显。
药物选择及起效速度
灌肠可用药物：灌肠常用的药物多是一些局部作用或能通过直肠吸收的药物，像小儿用的退热栓剂也可算一种特殊的灌肠类给药方式，主要用于退热等，起效相对输液可能稍慢一些，但能避免口服药物对胃肠道的刺激等。输液可用药物：输液可以使用的药物种类更多，能输入各种抗生素、维生素、电解质溶液等，药物能迅速分布到全身发挥作用，比如严重的细菌感染需要输入强效的广谱抗生素时，输液是主要的给药途径，能让药物快速达到有效血药浓度来控制感染。