面部肌肉萎缩的原因较多，其中神经源性因素较为常见。比如运动神经元病，这是一种慢性进行性神经系统变性疾病，约有5% - 10%的患者可能会出现面部肌肉受累的情况，导致面部肌肉萎缩。
神经源性因素
脊髓病变： 像脊髓空洞症，该病会使脊髓内形成空洞，影响神经传导，进而可能引发面部肌肉萎缩。患者可能会出现手部小肌肉萎缩，逐渐波及面部肌肉。脑部病变： 脑梗死如果发生在支配面部肌肉运动的区域，由于局部脑组织缺血坏死，会影响神经对肌肉的控制，从而导致面部肌肉萎缩。一般脑梗死发病后，若治疗不及时，就有可能出现相应的神经功能缺损症状，包括面部肌肉问题。
肌源性因素
肌营养不良症： 这是一组遗传性肌肉变性疾病，其中面肩肱型肌营养不良症就会累及面部肌肉，导致面部肌肉萎缩。通常在青少年时期发病，逐渐出现面部表情肌无力、萎缩，表现为闭眼无力、吹口哨困难等。炎性肌病： 多发性肌炎是一种自身免疫性疾病，可累及全身骨骼肌，当面部肌肉受到影响时，就会出现面部肌肉萎缩。患者可能伴有肌肉无力、疼痛等症状，血液中肌酶会升高。
废用性因素
长期固定姿势： 如果面部曾经因为外伤等原因长时间固定，比如面部骨折后长时间佩戴固定装置，导致面部肌肉活动减少，就可能引起废用性面部肌肉萎缩。一般这种情况在解除固定装置后，经过适当的康复训练，肌肉功能有可能恢复，但如果长期不活动，萎缩可能会加重。神经系统疾病导致的长期不活动： 比如帕金森病患者，由于面部肌肉运动减少，长期处于相对静止状态，也可能出现面部肌肉萎缩。帕金森病患者会有运动迟缓、肌强直等表现，面部表情减少，长期下来面部肌肉会逐渐萎缩。