艾滋病主要侵犯人体的免疫系统。人体免疫系统中有个重要的淋巴细胞叫CD4+T淋巴细胞，艾滋病病毒会专门攻击这类细胞，一般来说，感染艾滋病病毒后，体内CD4+T淋巴细胞数量会逐渐下降。
免疫系统的受损表现
淋巴细胞被破坏：艾滋病病毒主要攻击CD4+T淋巴细胞，让这种重要的免疫细胞数量不断减少。正常情况下，人体CD4+T淋巴细胞有一定数量范围，而感染艾滋病后，该细胞数量会逐步降低，当降低到一定程度时，人体免疫功能就会出现明显异常。免疫功能下降：由于免疫系统中关键的淋巴细胞被大量破坏，人体的免疫防御能力大幅减弱。此时，人体就很容易受到各种病原体的侵袭，像细菌、病毒、真菌等都可能趁虚而入，引发各种机会性感染，比如肺孢子菌肺炎，这种肺炎在艾滋病患者中较为常见，会严重影响患者的呼吸功能；还可能出现如带状疱疹等病毒感染，皮肤会出现大片疱疹，给患者带来痛苦。
消化系统也受牵连
胃肠道黏膜受损：艾滋病病毒感染后，不仅影响免疫系统，还会波及消化系统。胃肠道黏膜会受到损伤，导致患者出现腹泻症状。有的患者腹泻程度较轻，可能只是每天次数稍有增加；但严重时，每天腹泻次数能达到十余次甚至更多，而且大便多为稀水样便，长期这样会导致患者营养不良，体重明显下降。影响营养吸收：因为胃肠道黏膜受损，食物的消化和吸收功能受到阻碍。患者即使摄入足够的营养物质，也难以有效地吸收利用，进一步加重了营养不良的状况，使得患者身体状况愈发糟糕，抵抗力也会持续降低。
神经系统也不能幸免
神经组织受损：艾滋病病毒还可能侵犯神经系统，导致神经组织受到损伤。患者会出现神经系统相关的症状，比如头痛，这种头痛可能是持续性的，程度轻重不一；还可能出现记忆力减退的情况，患者会发现自己对近期发生的事情很难记住，严重影响日常生活和工作。认知和行为改变：随着病情的发展，神经系统受损进一步加重，患者可能会出现认知功能障碍，像思维变得迟钝，理解和判断能力下降；行为也可能发生改变，比如变得淡漠、孤僻等，给患者本人和其家庭都带来很大的困扰。