怀孕40天时，胚胎刚刚着床，此时进行药流是比较合适的。米非司酮和米索前列醇是两种常用的药流药物，它们能起到终止妊娠的作用。需要注意的是，药流必须在有正规抢救条件的医疗机构进行，在医生的指导下服用药物，以免发生危险。自行服用药物流产可能会导致大出血、流产不全等后果，甚至会威胁生命安全。因此，不建议你自行使用中药进行药流。
如果你不想要这个孩子，建议你及时去医院进行检查，在医生的指导下选择合适的方式终止妊娠。同时，在进行药流或其他终止妊娠的方法后，需要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持会阴部清洁卫生，勤换内裤和卫生巾，加强营养，多吃富含蛋白质和维生素的食物，促进身体恢复。