小儿疱疹性咽峡炎主要由柯萨奇病毒A组引起，治疗上以对症处理为主。一般病程在1周左右，多数患儿可自行康复。
一、一般治疗注意事项
休息方面： 患病小儿需要多休息，保证充足的睡眠，这有助于身体恢复免疫力，一般建议每天保证10~12小时的睡眠时间。隔离方面： 因为疱疹性咽峡炎具有传染性，要将患儿隔离2周左右，避免交叉感染给其他儿童。
二、对症用药情况
退热药物： 当小儿体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚来退热，它能通过抑制前列腺素合成发挥解热镇痛作用，适用于3个月以上的小儿。缓解咽痛药物： 可以使用含漱液，如生理盐水，让小儿漱口，能起到一定的清洁口腔、缓解咽部不适的作用；也可以使用喷雾，如西瓜霜喷雾，直接喷在咽部，减轻咽痛症状，但要注意2岁以下小儿使用需谨慎。
三、饮食护理要点
饮食温度： 给小儿提供的食物温度要适中，不宜过冷或过热，以免刺激咽部加重疼痛，一般控制在37~40℃比较合适。食物选择： 应给予清淡、易消化的流质或半流质食物，比如小米粥、软面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，像辣椒、油炸食品等，这类食物会加重咽部不适。