三九胃泰和舒肝健胃丸均为中药制剂，都有治疗胃部疾病的功效，但在成分、功效、主治、不良反应等方面均有不同，具体如下：
1.成分：三九胃泰由三叉苦、九里香、两面针、木香、黄芩、茯苓、地黄、白芍组成；舒肝健胃丸由厚朴、香附、白芍、柴胡、青皮、陈皮、枳壳、槟榔、牵牛子、豆蔻、鸡内金、延胡索、五灵脂、牵牛子组成。
2.功效：三九胃泰清热燥湿，行气活血，柔肝止痛；舒肝健胃丸疏肝开郁，导滞和中。
3.主治：三九胃泰用于上腹隐痛，饱胀，反酸，恶心，呕吐，纳减，心口嘈杂；舒肝健胃丸用于肝胃不和引起的胃脘胀痛，胸胁满闷，呕吐吞酸，腹胀便秘。
4.不良反应：三九胃泰尚未明确；舒肝健胃丸孕妇禁用。
需要注意的是，以上信息仅供参考，如需使用三九胃泰和舒肝健胃丸，建议在医生的指导下进行，避免自行用药。同时，在使用任何药物期间，都应注意饮食清淡、易消化，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以免影响药效或加重病情。