怀孕初期流血可能由多种原因引起，约1/4的孕妇在孕早期会有少量阴道流血情况。
先兆流产导致的流血
胚胎因素： 胚胎染色体异常是最常见的原因，占50%~60%。比如夫妻双方任何一方染色体异常，都可能遗传给胚胎，导致胚胎发育异常，引发先兆流产出现流血症状。母体因素： 孕妇患有全身性疾病，像严重感染、高热疾病等，会影响胚胎发育从而引起流血。另外，孕妇内分泌异常，如黄体功能不全，会使孕激素分泌不足，无法维持妊娠，也会导致怀孕初期流血。
宫外孕引发的流血
输卵管炎症： 这是宫外孕最主要的病因，约占90%。比如盆腔炎性疾病未得到及时治疗，炎症蔓延至输卵管，导致输卵管黏膜粘连，管腔变窄，影响受精卵正常运行，使受精卵在输卵管着床，引发宫外孕，出现不规则阴道流血，量一般少于月经量。输卵管发育不良或功能异常： 输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等发育不良情况，或者输卵管蠕动、纤毛活动以及输卵管上皮细胞分泌功能异常，都可能干扰受精卵正常运输，增加宫外孕发生几率，进而引起怀孕初期流血。
宫颈病变导致的流血
宫颈息肉： 宫颈局部组织增生形成息肉，质地较脆，怀孕后由于激素变化等因素，息肉容易出血，表现为怀孕初期少量阴道流血，颜色鲜红。宫颈炎： 孕妇患有宫颈炎时，宫颈黏膜充血水肿，怀孕后受到刺激也可能出现少量阴道流血，同时可能伴有白带增多、质地异常等表现。