腘窝囊肿不治疗可能会导致以下问题：
疼痛和不适：囊肿可能会压迫周围的神经和组织，引起疼痛、麻木、无力等症状，影响正常的活动和生活质量。
关节活动受限：囊肿的存在可能会限制膝关节的伸展和弯曲，导致关节活动受限，影响膝关节的功能。
感染和炎症：如果囊肿破裂或受到感染，可能会引起炎症反应，导致局部红肿、疼痛、发热等症状。
影响治疗效果：如果患者同时患有其他疾病，如膝关节骨性关节炎等，腘窝囊肿可能会影响这些疾病的治疗效果。
因此，对于腘窝囊肿，建议及时就医，根据具体情况选择合适的治疗方法，如保守治疗、手术治疗等。同时，在治疗期间，患者应注意休息，避免过度活动，保持膝关节的保暖，以促进病情的恢复。