头孢克肟和头孢氨苄都是抗生素药物，都属于头孢菌素类，但在化学结构、抗菌谱、药代动力学、不良反应等方面存在一些区别。
1.化学结构：头孢克肟属于第三代头孢菌素，头孢氨苄属于第一代头孢菌素。
2.抗菌谱：头孢克肟对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都有抗菌作用，尤其对革兰氏阴性菌的抗菌作用更强。头孢氨苄主要对革兰氏阳性菌有抗菌作用，对革兰氏阴性菌的抗菌作用较弱。
3.药代动力学：头孢克肟口服吸收良好，生物利用度高，血药浓度高，半衰期长。头孢氨苄口服吸收较差，生物利用度低，血药浓度低，半衰期短。
4.不良反应：头孢克肟的不良反应较少，主要有胃肠道反应、过敏反应等。头孢氨苄的不良反应较多，主要有胃肠道反应、过敏反应、血液系统反应等。
需要注意的是，头孢克肟和头孢氨苄都是处方药，需要在医生的指导下使用。在使用过程中，应注意过敏反应、胃肠道反应等不良反应的发生，如有不适应及时就医。同时，应避免与其他药物同时使用，以免发生药物相互作用。