长期转氨酶高可能会带来多方面的不良后果。一般来说，转氨酶持续升高若不及时处理，会对肝脏造成渐进性损伤。比如，长期转氨酶高可能导致肝脏纤维化，若病情进一步发展，还有可能向肝硬化甚至肝癌方向演变。
对肝脏组织的损害
肝细胞持续受损： 转氨酶主要存在于肝细胞内，长期转氨酶高意味着肝细胞一直在受到损伤，会影响肝脏正常的代谢、合成等功能。随着时间推移，受损的肝细胞会逐渐被纤维组织替代，引发肝脏纤维化。就像一座建筑，不断有砖块损坏却没有及时修复，慢慢就会出现结构的改变。加重肝脏负担： 肝脏本身在努力修复受损细胞，长期转氨酶高会让肝脏始终处于高负荷的修复状态，进一步影响肝脏整体功能，使肝脏代谢药物、毒素等能力下降，形成恶性循环。
对身体其他系统的影响
消化系统受牵连： 肝脏功能异常会影响胆汁分泌，进而影响食物的消化和吸收，长期转氨酶高的人可能会出现食欲不振、恶心、呕吐、腹胀等消化系统症状，影响营养摄入，导致身体整体状况变差。全身乏力不适： 由于肝脏代谢功能受影响，身体能量代谢出现紊乱，患者常常会感觉全身乏力，做稍微一点活动就容易疲倦，严重影响日常生活和工作。
增加相关疾病风险
肝硬化风险上升： 长期转氨酶高引发肝脏纤维化后，若病情持续进展，很可能发展为肝硬化。肝硬化会导致肝脏正常结构破坏，出现门静脉高压、腹水、上消化道出血等一系列严重并发症，严重威胁健康。肝癌风险增加： 肝脏长期受损修复过程中，细胞发生异常突变的几率增加，长期转氨酶高会使肝癌的发病风险明显高于转氨酶正常的人群。据相关研究统计，长期转氨酶高且未有效控制的患者，患肝癌的可能性比正常人高出数倍。