云南白药白瓶和红瓶的主要区别在于功效和适用症状不同。白药气雾剂（白瓶）的主要功效是活血散瘀、消肿止痛，常用于跌打损伤、瘀血肿痛、肌肉酸痛及风湿疼痛。红瓶的主要功效是化瘀止血、活血止痛、解毒消肿，主要用于治疗跌打损伤、瘀血肿痛、吐血、咳血、便血、痔血、崩漏下血、手术出血、疮疡肿毒及软组织挫伤、闭合性骨折、支气管扩张及肺结核咳血、溃疡病出血、以及皮肤感染性疾病。
需要注意的是，这两种药物都只能用于外用，切勿口服。使用时应先振摇，喷嘴离皮肤5至10厘米，喷射时间应限制在3至5秒，以防局部冻伤。皮肤受损者勿用。孕妇禁用。在用药期间，应避免吃生冷、辛辣、油腻食物。