头疼发热可能由多种原因引起，比如普通感冒就比较常见，一般来说普通感冒导致的头疼发热，病程通常在7天左右。
感染性疾病导致
病毒感染：像流感病毒引起的流感，除了头疼发热，还常伴有全身酸痛、乏力等症状，流感的传染性较强，在人群密集处容易传播。而普通的病毒性感冒，也会引发头疼发热，症状相对流感稍轻些，一般通过休息、对症处理能逐渐恢复。细菌感染：比如肺炎链球菌引起的肺炎，除了头疼发热，还可能有咳嗽、咳痰，严重时会有呼吸困难等表现；还有化脓性扁桃体炎，也会出现头疼发热，同时扁桃体红肿、化脓，吞咽疼痛明显。
非感染性疾病导致
自身免疫性疾病：例如系统性红斑狼疮，除了头疼发热，还可能有面部红斑、关节疼痛等症状，病情容易反复发作，需要长期规范治疗。还有类风湿关节炎，也会出现头疼发热情况，同时伴有关节肿胀、畸形等问题。中暑：在高温环境下停留时间过长就可能中暑，会出现头疼发热，还可能伴有口渴、多汗、四肢无力等症状，严重中暑可能会出现昏迷等危急情况。
其他因素
环境因素：长时间处于闷热、不通风的环境中，可能会引起头疼发热，离开闷热环境后，适当休息，补充水分，症状会有所缓解。药物副作用：某些药物服用后可能会出现头疼发热的不良反应，比如降压药等，这时候需要咨询医生是否需要调整用药。