三个月宝宝纯母乳喂养时拉粑粑有血丝，可能是以下原因引起：
1.肛裂：宝宝肛门周围的皮肤或黏膜出现裂口，可能导致拉粑粑时有血丝。通常伴有疼痛、哭闹等症状。
2.肠套叠：一段肠管套入相邻的肠管，导致肠内容物通过受阻。可能出现腹痛、呕吐、血便等症状。
3.感染：如肠炎、痢疾等，可导致肠道炎症和黏膜损伤，出现血便。
4.维生素K缺乏：如果宝宝体内维生素K不足，可能影响凝血功能，导致出血。
5.其他：如食物过敏、肠道息肉等也可能引起血便。
如果发现宝宝拉粑粑有血丝，需要采取以下措施：
1.观察宝宝的一般情况，如精神状态、食欲、哭声等。
2.注意宝宝的饮食，如果是母乳喂养，妈妈应注意自己的饮食，避免食用辛辣、刺激性食物。
3.保持宝宝肛门周围的清洁，便后用温水清洗。
4.及时带宝宝就医，进行详细的检查，如大便常规、潜血试验、腹部超声等，以明确原因。
5.根据医生的建议进行治疗，如肛裂可能需要涂抹药膏，感染可能需要使用抗生素等。
需要注意的是，血便的原因可能较为复杂，有时需要进一步检查和治疗。在处理过程中，如果宝宝出现精神萎靡、高热、哭闹不止等异常情况，应立即就医。同时，定期带宝宝进行儿童保健检查，及时发现和处理问题。