根管治疗侧穿是根管治疗过程中比较严重的并发症之一，需要及时就医，根据具体情况进行处理。如果侧穿较小，可以进行修补；如果侧穿较大，可能需要拔牙。
根管治疗后牙疼的原因可能是多种多样的，以下是一些可能的原因：
1.感染：根管治疗不彻底，导致根管内仍有细菌感染，会引起牙疼。
2.牙根纵裂：根管治疗后，牙根可能会发生纵裂，导致牙疼。
3.填充物过高：根管治疗后，填充物过高，会压迫牙齿，引起牙疼。
4.咬合问题：根管治疗后，牙齿的咬合可能会受到影响，导致牙疼。
5.其他：如牙根吸收、牙髓炎等。
患者在根管治疗后需要注意以下几点：
1.按照医生的建议进行护理，包括使用药物、避免咬硬物等。
2.注意口腔卫生，保持口腔清洁。
3.如果出现牙疼等不适，应及时就医。
4.避免食用辛辣、刺激性食物，以及过于坚硬的食物。
总之，根管治疗侧穿和根管治疗后牙疼都需要及时就医，进行专业的治疗。同时，患者在治疗期间需要注意口腔卫生，按照医生的建议进行护理，以促进恢复。