脊柱融合术可能带来一些危害，比如术后相邻节段退变风险增加，有研究显示约10% - 30%的患者在术后几年内会出现相邻节段的椎间盘退变加速等情况。
关节活动度受限
术后早期：脊柱融合术后，由于脊柱被固定，短期内关节活动度会明显下降，患者可能在术后几周内发现弯腰、转身等动作变得不灵活。一般来说，融合节段越多，关节活动度受限越明显。长期影响：长期来看，非融合节段为了代偿融合节段的功能，可能会出现过度使用，进一步影响整体的关节活动范围，有的患者会感觉活动时不如术前灵活，甚至影响日常的弯腰、抬手等动作。
融合失败风险
手术技术因素：如果手术中融合部位的骨融合不佳，就可能导致融合失败。例如，手术操作时骨床准备不充分、植入的骨移植物质量不好等，大约有5% - 10%的脊柱融合术存在融合失败的可能。患者自身因素：一些患者自身的身体状况也会影响融合效果，比如患有糖尿病的患者，血糖控制不佳时，骨愈合能力下降，融合失败的概率会高于血糖控制良好的患者。另外，吸烟的患者，烟草中的尼古丁等成分会影响血液循环和骨代谢，也会增加融合失败的风险。
神经损伤风险
术中损伤：在脊柱融合手术过程中，有一定概率会损伤神经。虽然现代手术技术不断提高，但仍有约1% - 2%的概率出现术中神经损伤，可能导致下肢麻木、无力甚至大小便失禁等严重问题。术后并发症导致：术后如果出现血肿等情况压迫神经，也可能引发神经损伤相关症状。比如术后血肿形成，压迫到脊髓或神经根，就可能在术后几天内出现神经功能障碍的表现，需要及时处理。