幼儿咳嗽反复发烧可能是多种原因引起的，比如感染性因素，像病毒感染、细菌感染等。一般来说，病毒感染引起的反复发烧可能会持续3 - 5天左右，细菌感染相对病程可能有差异。
常见感染性原因
病毒感染：
普通感冒病毒： 像鼻病毒等引起的感冒，除了咳嗽、反复发烧外，还可能伴有流涕、鼻塞等症状。一般体温可能在38℃ - 39℃左右波动，咳嗽多为轻到中度咳嗽。流感病毒： 感染流感病毒引起的幼儿咳嗽反复发烧，症状往往比较重，体温可能更高，能达到39℃以上，而且全身症状明显，比如精神差、肌肉酸痛等，咳嗽也较为剧烈，可能伴有喘息等情况。
细菌感染：
肺炎链球菌感染： 幼儿如果感染肺炎链球菌，会出现咳嗽、反复发烧，体温持续升高，可达39℃甚至更高，咳嗽咳痰比较明显，痰液可能呈脓性，还可能伴有呼吸急促等表现。化脓性链球菌感染： 除了咳嗽、反复发烧外，可能会有咽部红肿、化脓等局部表现，咳嗽时可能会有咽痛加重的情况。
非感染性原因
过敏因素：
吸入过敏原： 比如幼儿吸入花粉、尘螨等过敏原，会引发气道过敏反应，出现咳嗽，多为刺激性干咳，同时可能伴有反复低烧情况，一般体温不会太高，多在37.5℃ - 38℃左右，脱离过敏原后症状可能会有所缓解，但如果持续接触过敏原，症状会反复。食物过敏： 幼儿食用某些过敏食物后，也可能出现咳嗽反复发烧，比如对牛奶、鸡蛋过敏，除了咳嗽外，可能还会有皮肤皮疹等表现，发烧一般也是反复低热为主。
其他非感染性原因：
气道异物： 如果幼儿不小心吸入小物件等气道异物，也会出现咳嗽反复发烧，咳嗽往往是突然发生的呛咳，然后出现反复咳嗽，发烧可能是因为异物刺激气道引起炎症反应导致，体温一般呈低热到中度发热。自身免疫性疾病： 虽然相对少见，但像幼年特发性关节炎等自身免疫性疾病，也可能出现幼儿咳嗽反复发烧，往往还伴有其他系统的一些表现，比如关节肿痛等，但这种情况相对比较复杂，需要进一步检查诊断。