治疗毛囊炎最好的软膏因人而异，需要根据具体情况选择合适的药物。以下是一些常用的治疗毛囊炎的软膏：
1.莫匹罗星软膏：这是一种局部外用的抗生素软膏，主要用于治疗革兰氏阳性球菌引起的皮肤感染，如脓疱疮、疖肿、毛囊炎等。对该药过敏者禁用。使用时应注意局部清洁，避免搔抓和挤压。
2.夫西地酸乳膏：同样是一种抗生素乳膏，对与皮肤感染有关的各种革兰氏阳性球菌尤其对葡萄球菌高度敏感。使用过程中偶有轻微刺激感，对该药过敏者禁用。
3.酮康唑乳膏：如果毛囊炎是由真菌感染引起的，如马拉色菌毛囊炎，可使用酮康唑乳膏等抗真菌药物进行治疗。使用时需注意药物的不良反应，如局部刺激、过敏等。
4.碘酊：碘酊具有消毒、杀菌的作用，可用于治疗毛囊炎。但碘酊对皮肤有一定的刺激性，使用时需注意浓度，避免接触到正常皮肤。
5.鱼石脂软膏：具有抗菌消炎、消肿止痛的作用，可用于治疗疖肿、毛囊炎等。使用时需注意局部清洁，避免感染加重。
需要注意的是，以上药物均需在医生的指导下使用，根据病情的严重程度、病因等选择合适的药物。同时，在治疗过程中，还应注意个人卫生，保持皮肤清洁，避免搔抓、挤压患处，以免加重感染。如果毛囊炎症状严重或持续不愈，应及时就医，以便进行进一步的诊断和治疗。