增加感染风险
月经期女性的宫颈口处于相对开放状态，此时自慰若不注意卫生，容易将外界的细菌等病原体带入阴道、子宫等生殖器官内，引发阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等妇科炎症。例如，相关研究表明，经期不注意卫生的自慰行为会使女性患妇科感染性疾病的风险显著升高。对于女性而言，在月经期间自身抵抗力相对较低，更易受到病原体的侵袭。
导致月经紊乱
自慰时的刺激可能会引起子宫收缩，在月经期可能会干扰正常的月经周期和经血量。过度的刺激可能导致子宫收缩过强或不规律，从而出现月经量增多、月经经期延长等月经紊乱的情况。有临床观察发现，经常在月经期自慰的女性，出现月经周期改变的比例高于没有此类行为的女性。不同个体对这种刺激的反应可能有所差异，但总体上会对月经的正常状态产生不良影响。
心理方面的影响
部分女性可能会因在月经期自慰产生愧疚、焦虑等不良心理情绪。尤其是在受到社会文化观念影响下，可能会对自身的行为产生负面评价，进而影响心理健康。对于处于青春期的女性来说，由于身心发育尚未完全成熟，这种心理影响可能更为明显，需要正确引导来缓解可能出现的心理压力。
对生殖系统健康长期潜在影响
长期频繁在月经期自慰，可能会对生殖系统的长期健康产生潜在威胁。例如，增加今后患盆腔炎等更严重妇科疾病的可能性，而盆腔炎可能会影响生育功能等。从长期的健康角度来看，会对女性的生殖健康带来不利的因素。对于有生育计划的女性而言，这种潜在影响更需引起重视，因为生殖系统的健康状况与未来的生育息息相关。